在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

科学研究后果

1、从光敏培养教育神经细胞中取出DNA化学交联血清质

为了能让溶合光热塑胆固醇酶质-DNA塑料物适用LC-MS分折，小说作家建设了一大种性质发生变化纯化计划，可从DNA中去要不是热塑胆固醇酶质，仅在直晒时利用可以什么是基因组沾染含有DNA热塑胆固醇酶质。用TRIZOL转化成着色质并删去逮捕获的非热塑胆固醇酶，接下来将其再一次溶于以来进行RNase代谢。利用超声波截取视频应纳税所得额胆固醇酶质热塑DNA的转化成物，在硫氰酸胍中煮开性质发生变化，并在二氧化的硅离心分离柱上心跳加快洗衣以去要不是热塑胆固醇酶质直到完工。利用核酸酶操作从DNA中移除光热塑胆固醇酶，并来进行胰胆固醇酶酶代谢适用LC-MS分折。该技巧命名为为胆固醇酶质热塑DNA转化成或XDNAX。

图1.蛋白质交连DNA分离出或XDNAX流程表图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可间接交往DNA的蛋白质含量质图谱

将光热塑做法用途于MCF7内部，发觉了1,805种侯选人蛋清质，在这当中1,191种具备于3个或更好地次重复使用中。60%的DNA互相功能组有点核酸紧密结合实际的GO标注，在没有核酸紧密结合实际标注的蛋清质质中，非常大的功绩来源于核纤层蛋清质，二、是参与者固色质组织结构和内部分裂主义的蛋清质质（图2）。

图2 . 可就直接接触的面积 DNA 的蛋白酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3工作小结了DNA主动的功效组所隐藏的淀粉酶质-DNA画面下列不属于包含了的核苷酸交连肽。这还有主要是因为（1）球状DNA搭配结构类型域、（2）DNA 搭配起居不规律区（IDR）和（3）主要是因为与其他淀粉酶质（如组淀粉酶搭配淀粉酶）、RNA（如剪接系数）或相分离处理区室（如核仁淀粉酶）主动的功效而造成的的的环境介于。

图3 . 可同时接处 DNA的设计域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、一定量血细胞扰动期间里与DNA相结合的转录指数

雌雌二醇肾上腺素受体α（ESR1）驻留到胞质溶胶中，直至面对其配体，释放易位到癌内部质，在处它与dna组中的不同范围组合以激活码不同的转录程度。将血清饥饿的MCF7癌内部体现于高药量雌雌二醇（10 nM 17β-雌二醇）4两多分钟，与模仿处理的相较较好癌内部较好想一想的DNA上下级之间使用组（图4A）。进来，雌雌二醇影响后DNA上下级之间使用组中的ESR1增高了30倍（图4B）。另一方面就，在1,814个降钙素原检测的淀粉酶质-DNA上下级之间使用中，约有9%彰显出高于2倍的特殊变迁，并观测到与ESR1具备上下级之间使用的淀粉酶如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌抗生素整理乳线癌受损细胞 DNA 之间用处组的降钙素原检测比（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

探索探讨进基因遗传遗传组的血清质以介绍它是要怎样被加载并付诸实训的，一直以来是科技创新成员一名长久的的理想。基因遗传遗传组可及性主要是以DNA为重心的角度来开展探索探讨，而是，到迄今截止截止，着色质抑菌凝胶中的什么样血清质与DNA 造成物理化学双方间用途尚不清析。安全使用零范围光热塑，可发现了DNA双方间用途组中的大部分数血清质，XDNAX工艺将有所作为血清质-DNA双方间用途探索探讨的厉害交通工具。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的营养物质质组学、绘制组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

分类文献综述：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.