
化学上蛋白质组学的技术:精准扶贫“钓鱼”
依托于渗透性的蛋白酶质成分析(ABPP)
ABPP主要基于活性小分子探针与靶蛋白之间的特异性相互作用,找到与小分子直接相互作用的靶点,并可以特异性地标记具有特定功能的蛋白质,比如膜蛋白。这些探针能够共价或非共价地结合具有特定活性的靶蛋白,主要流程包括探针制备、孵育、反应与标记、蛋白富集与质谱鉴定(如下图)。
图源:10.1038/s41392-020-0186-y
文献综述锦集
(电脑端回应“ABPP”,抓取PDF程序)
局限性酶解-质谱解析(LiP-MS)
LiP-MS基于蛋白质构象变化导致酶切位点可及性改变的原理。在生理状态下,折叠的蛋白质对蛋白酶切割具有抗性;当小分子结合后,可能通过稳定或破坏蛋白质结构改变酶切位点暴露程度,产生差异化的酶切片段。通过质谱检测这些片段的变化,可推断小分子与蛋白质的结合信息(如下图)。无需额外的化学修饰,同时提供蛋白质丰度和结构变化两个维度的信息。值得一提的是,拜谱生物LiP-MS升级产品SPIA已研发完成,不仅数据真实性提高,结果的假阳性率降低,更具有高特异性和高灵敏度特点,欢迎咨询。
文献综述集绵
(后台界面发信息“LiP-MS”,拿PDF档案)
热蛋白酶质混合物析(TPP)
蛋白质在加热过程中会因配体(如药物)结合而改变构象,导致热熔点(Tm)偏移。TPP通过测量不同温度下可溶性蛋白的丰度变化,筛选出与配体结合的蛋白(如下图)。该方法能够反映天然状态的结合情况,也无需进行额外的化学修饰。
图源:10.1016/j.crmeth.2024.100717
文献综述集绵
学术论文集绵(后台管理系统回应“TPP”,取得PDF信息)
网站临床药理学:打造中要意义网站的关键点
网格药学学就像是一张巨大而复杂的关系网,它整合了中药成分、靶点、疾病等多方面信息,通过构建网络模型,全面揭示中药多成分、多靶点、协同作用的特点。利用网络药理学,我们可以将中药中的活性成分与它们潜在作用的靶点以及相关疾病联系起来,如同绘制一幅详细的地图,清晰展示中药作用的全貌。
急病-原子-靶点互联网
分子式结构衔接:精准预测分子式结构间互为功能的 “神算子”
分子结构嫁接仿佛是一场精心策划的 “相亲大会”,它通过计算机模拟,预测中药活性成分与靶点蛋白之间的结合模式和亲和力(如下图)。研究人员将中药活性成分的分子结构和靶点蛋白的三维结构输入计算机,利用专业的分子对接软件,模拟两者相互靠近、结合的过程,计算出它们之间的结合能等参数,从而判断活性成分与靶点蛋白结合的可能性和紧密程度。
拜谱个人总结
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