N6-甲基腺苷（m6A）是真核微生物体mRNA中最沉要的转录后体现，在真核微生物体的病理学和内分泌系统的方式中起着至关首要的用途。高血压认同困难是一个种不可逆转的交感精神精神系统的退行性急病，现今转型着实切规则已经充分表明，但会欠缺管用的防冶和治療策略。

2024年2月6日，北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物体为其提供m6A甲基化具体分析技木服务质量，为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

稿件名字：Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice（Int J Mol Sci.，IF=6.2，2024.2）

顾客部门：北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

研究探讨村料：小鼠脑组织

拜谱展示技术水平：m6A甲基化（MeRIP-seq）

论文摘要图：

图1| 提要图(图源：Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

探讨結果

1.DCI小鼠海马中m6A遗传基因修饰语的调整

理论浅析人一开始建立联系了高脂美食和群体行为缺陷（DCI）的小鼠仿真模型。为更加比较组(n = 3)和DCI组(n = 3)彼此的m6A遗传表观遗传绘制，理论浅析人施用MeRIP-seq来了转录组范围之内内的m6A-seq浅析。在DCI组的10664个编号规则遗传表观遗传转录物(mRNAs)国共发觉比较组的23714个不偏移的m6A峰。比起来之侧，DCI组特征出23,754个非偏移m6A峰。但其中，934五类甲基化遗传表观遗传在比较组和DCI组彼此偏移(图2)。

图2| 相较比较组和DCl组m6a绘制遗传基因的维恩图

共技术鉴定出1276个差别甲基化的m6A位点(DMMSs)，这其中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化技术水平各用重要少于剖析组。解析其匀称具体情况知道m6A峰匀称在全部RNA中(图3A)，并要根据其匀称的转录部位划分为一些五组：5'UTR、3'UTR、转录起讫位点部位电影段落、停止支付密码锁锁子电影段落、起讫支付密码锁锁子电影段落和数字字段(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和停止支付密码锁锁子付进重要聚集(图3B)。从而风险估评这遗传基因遗传上m6A呈现的部位，研究分析师需求了有峰参考文献标注的部位，并测量了这遗传基因遗传上reads的复盖率。在DCI组中，m6A呈现区偏斜于3'UTR区(图3C)。所以mRNA内的DMMS都被固定到着色体过去风险估评其匀称情况。各不相同小鼠着色体的m6A呈现谱各不相同。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的发生变化

只为测试m6A绘制在DCI小鼠中的生物技术工程学基本功能，理论研究的人员从多组任选择富含DMMS的蛋白质简码表观遗传使用GO和KEGG分折(图4A)。在GO分折中，高甲基化表观遗传在内部的的时候、生物技术工程的的时候国家宏观调控、促使剂的作用抗逆性和杂环无机无机无机化合物构建中有关的系数生物聚集。KEGG径路分折呈现，高甲基化表观遗传与T内部蛋白激酶电磁波径路、小内部肺肿瘤和RIG-I样蛋白激酶电磁波径路有关的(图4B)。对於低甲基化表观遗传，GO分折呈现在内部的的时候、新陈代谢的的时候和构建的的时候中有关的系数生物聚集设计环无机无机无机化合物、构建杂环无机无机无机化合物和促使剂的作用抗逆性(图4C)。KEGG径路分折呈现了低甲基化表观遗传与肥厚性心肌病和Hippo电磁波径路的关系(图4D)。

图4| 不一致性甲基化m6A位点的径路含有

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数值的协同浅析

陆陆续续介绍技术人员将m6A MeRIP-Seq的大数据界面显示和仍然RNA-Seq的大数据界面显示开展聯合介绍，感觉163个mRNA，m6A峰和mRNA层次显著性发生变化。41种mRNA的m6A和mRNA层次上涨，14种mRNA层次上涨。因此，30个人类DNAmRNA抒发上涨，m6A层次上涨，7八个人类DNAmRNA抒发上涨，m6A层次上涨(图5A)。末尾，整合一个多个PPI网格来界面显示163个人类DNA代码的血清两者之间的进行连接(图5B)。

如图已知6图示，GO和KEGG定性剖析包含四组：(1) m6A调涨，mRNA降低；(2) m6A调涨，mRNA调涨；(3) m6A降低，mRNA降低；(4) dna遗传m6A降低和mRNA调涨。在GO定性剖析中，m6A调涨和mRNA降低的dna遗传在组织精神元新陈分解阶段、果香族化学物质生物体提炼阶段和RNA新陈分解阶段的房产控制中相关系数聚集。KEGG定性剖析信息信息显示信息，等dna遗传在皮下脂肪堆积酸新陈分解、小组织精神元肝癌、丙酸新陈分解和二甲苯酸新陈分解中聚集。对于那些m6A调涨和mRNA调涨的dna遗传，GO定性剖析信息信息显示信息在亚铁综合、亚胺丙氨酸脱羧酶吸附性酶、天冬氨酸1-脱羧酶吸附性酶和组织精神元进行连接主装负房产控制中聚集；KEGG定性剖析信息信息显示信息在2型痛风、皮下脂肪堆积组织精神元要素数字数据表现通道和胰岛素数字数据表现通道中聚集。在GO定性剖析中，m6A降低和mRNA降低的dna遗传在寡肽综合、谷胱甘肽综合和二硫非金属被氧化物物非金属被氧化物保存酶吸附性酶中聚集，而在KEGG定性剖析中，它是在青柠檬酸循环往复系统(TCA循环往复系统)、丙酸新陈分解和多鱼类凋亡中聚集。在GO定性剖析中，m6A降低和mRNA调涨的dna遗传在胚胎骨环节结构发现、蛋清激酶吸附性酶系统激活和NADP新陈分解阶段中聚集，在KEGG定性剖析中，m6A降低和mRNA调涨dna遗传在新霉素、卡那霉素和精神鲜香美味要素数字数据表现通道中聚集。

图5| m6A甲基化与mRNA形容的携手定性分析

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG解析

拜谱生态学个人总结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变，特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解，可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物体提供了m6A甲基化枝术提供服务，拜谱菌物可提供完善成熟的淀粉酶组学、基础代谢组学、转录组学已经几组学合作食品的技术工作，欢迎致电咨询！

可以参考论文资料：Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.